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IBBR Project #63

PROGETTO BANDIERA EPIGENOMICA
Project ID 63
ID B78C11000230001
Acronym EPIGEN
Project acronym and title PROGETTO BANDIERA EPIGENOMICA
Contract PROGETTO BANDIERA EPIGENOMICA CNR EPIGEN
Description PROGETTO BANDIERA EPIGENOMICA - Sottoprogetto 8. Identificazione di varianti epigenetiche mediante studio dell’epigenoma in piante di interesse agrario - SP8.2. Modificazioni istoniche associate alle regioni di ricombinazione meiotica in Arabidopsis. Scopo: determinare il profilo epigenomico della modifica istonica H3K4me3 nelle cellule meiotiche di Arabidopsis e associarla alle regioni di ricombinazione meiotica. L’attività di ricerca si è focalizzata sull’ ottenimento del materiale necessario per applicare il metodo INTACT (Deal e Henikoff, Nat. Protoc. 2011). Pertanto sono state costituite linee transgeniche di Arabidopsis recanti sia il gene della biotinilasi (BirA) con promotore costitutivo per l’actina (ACTIN2) sia il gene NTF (Nuclear Tagging Factor) sotto il controllo del promotore meiosi-specifico AtDMC1. Una di queste linee è stata utilizzata per l’isolamento dei nuclei meiotici sui quali sono state effettuate l’analisi della modifica post-traduzionale dell’istone H3K4me3 tramite ChIPSeq e del trascrittoma con RNASeq in collaborazione con l’IGA di Udine
Funding body PNR 2011-2012
UOS Portici
Role Partner
Signatory Pignone Domenico
Contact Person Conicella Clara
Starting of activities 2011
Ending of activities 2015
Extension 2016-12-31
Amount (euro) 100000.00
Technological Area ITA0AGROALIMENTARE
Technological Field Intensificazione sostenibile delle produzioni agroalimentari e forestali
Select Projects
Istituto di Bioscienze e Biorisorse (IBBR/CNR)
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